Lineage Detector

Lineage Detector 是一款生物信息学工具，能够从基因组序列数据中快速识别新出现的 SARS-CoV-2 谱系。它基于 UShER 系统发育放置框架，能高效地为新病毒序列分配 Pango 谱系。

我从 2023 年起担任 Pango 谱系志愿观察员（Volunteer Spotter），参与全球 SARS-CoV-2 谱系监测，提出并维护了若干新的谱系命名。这款工具把这一工作流中的关键步骤自动化，帮助研究人员和公共卫生人员更快地追踪新变异株的出现。

这项工作以独立作者身份发表于 bioRxiv（2024），论文为 “Lineage Detector: Efficient Tool for Detecting New SARS-Cov-2 Lineages”。

欢迎访问 Lineage Detector，或浏览我提议并获命名的 Pango 谱系。